Скопируйте System.Runtime.dll из C:\Program Files\dotnet\shared\Microsoft.NETCore.App\3.1.x в папку с бинарником. Мы добавим автоматический поиск установленных NETCore в следующих билдах.
Вне зависимости от настроек VMProtect и версий .NET Core ( 3.1.0, 3.1.4, 3.1.8 ) происходит краш при компиляции. При этом создается .vmp.dll, но его размер полностью совпадает с оригиналом.